3小时实现病毒基因组鉴定,上海科技创新资源数据中心公益服务今开启

解放日报•上观新闻记者从上海科技创新资源数据中心获悉“根据病患的呼吸道样本二代测序数据,通过分析流程将样本数据与病毒基因库进行快速比对,3小时可检测出包括SARS、COVID-19等在内的所有人类已知基因组的病毒。”

  解放日报•上观新闻记者从上海科技创新资源数据中心获悉“根据病患的呼吸道样本二代测序数据,通过分析流程将样本数据与病毒基因库进行快速比对,3小时可检测出包括SARS、COVID-19等在内的所有人类已知基因组的病毒。”

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  此次研究由该中心联合中国科学院上海巴斯德研究所、中国科学院上海营养与健康研究所共同研发的基于二代测序数据的病毒基因组鉴定服务,从2月13日起通过上海科技创新资源数据中心官微,在线面向全国医疗机构、医生和医学研究者,免费开放至疫情全面结束。

  基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,国家卫健委对《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第五版)》解读时,特别针对鉴别诊断提到:“单从临床表现、胸部影像学难以鉴别,需依靠病原学检测来区分。”在当下疫情防控的攻坚阶段,精准的基因组测序对每一位病患及奋战在抗疫一线的医务工作者来说,都是有效、及时进行诊疗的重要依据。

  上海科技创新资源数据中心战略部科学数据产品经理左天宇介绍,此次免费开放的病毒基因组鉴定将根据病患的呼吸道样本二代测序数据,通过分析流程将样本数据与病毒基因库进行快速比对,3小时便可检测出包括SARS、COVID-19等在内的所有人类已知基因组的病毒。

  病毒基因组鉴定与核酸检查相比,优势在于:不仅可精准识别病毒基因特性,还能监测病毒变异趋势并及时做出更新判定。这与核酸检查还是有本质区别的,形象来说,病毒核酸检查做的是判断题,而病毒基因组鉴定做的是简答题。

  上海科技创新资源数据中心CTO张嘉锐表示:“希望病毒基因组鉴定所形成的鉴定分析结果,能为更多的医院、医生进行临床诊断和治疗提供参考,为全面分析研究病患的呼吸道病毒组、研究其致病因子提供支撑,同时为疫情防控、疾病诊治、药物筛选、疫苗设计与药物研发和对病毒朔源、变异进化、致病机理等研究工作提供支撑。”

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